這次水庫設計方案的關鍵就是選擇較好的防滲結構體，解決由庫區底部的強滲透性所造成的周邊土地鹽堿化問題。

垂直鋪塑技術是近年來新興的用于解決平原水庫基礎滲漏的技術措施之一。在探明庫區地質情況的前提下，確定垂直鋪塑深度。施工采用開槽機，配合泥漿固壁，將與槽深相當的卷軸塑料膜插入槽中，沿槽倒轉軸卷，使膜展開，膜接頭采用粘接或焊接。膜底部嵌入不透水層，頂部與壩底腳混凝土腳趾相聯，形成不透水的防滲墻，從而達到截滲的目的。

復合土工膜是理想的防滲材料。為減少壩體的滲透能力，水庫的內堤坡采用了在混凝土板護坡下鋪設復合土工膜的防滲措施。布置型式為在圍堤內坡平鋪1層復合土工膜，其規格為100g/㎡+PE0.3+100g/㎡。復合土工膜底部與垂直鋪塑薄膜粘合，上部嵌入混凝土防浪墻底部，土工膜接頭采用焊接，焊接寬度不小于10cm。按規范要求，土工膜防滲系統應進行穩定性驗算和膜后排滲能力驗算。

大浪淀水庫土工膜防護層為12cm厚混凝土護坡，與土工膜的摩擦系數為0.55，土工膜鋪放坡角為18.4°，抗滑穩定安全系數為1.65，滿足抗滑穩定要求。膜后排滲能力驗算主要是驗算當上游水位驟降時，壩體中部分水量將流向上游，沿土工織物順流至坡底，經壩底排水管或導水溝導向下游的能力，以此來確定膜后土工織物的導水率和土工織物的層數。該工程在膜后排滲能力不滿足要求的部分區域增加了土工布層數，使膜后導水率達到設計要求。