膨潤土防水毯的鋪設宜采用人工鋪設。按規定順序和方向，分區分塊進行膨潤土防水毯的鋪設。膨潤土防水毯應以品字形成布，盡量避免有十字形疊口出現。底面鋪設時應平行搭接，不可平行對接，且不可張拉過緊，應適量放松并緊貼地面。 膨潤土防水毯兩邊的土工織物分別為無紡布和編織布，鋪設時無紡布朝上。鋪設至加強部位時需先去除臨時的PE保護膜，再繼續鋪設。 膨潤土防水毯平面搭接寬度應為250mm，在搭接底層膨潤土防水毯的邊緣150mm處撒上寬度為50 mm膨潤土粉狀密封劑，重量為0. 5 kg/m。遇有大風天氣時可將粉狀密封劑用等量清水調成膏狀，在按上述要求涂抹于毯上。
 
膨潤土防水毯應自然松弛與支持層貼實，不宜折褶、懸空。在河底的各邊界處鋪設防水毯時，應使膨潤土防水毯與坡面或護岸預留的膨潤土防水毯搭接完好。
 
鋪設過程中應隨時檢查膨潤土防水毯的外觀有無破損、孔洞等現象。發現有孔洞或損傷時，應及時用膨潤土或膏修補，并用破損部位周邊放大25cm以上的膨潤土防水毯進行局部覆蓋修補處理。